（1）流行病学

研究方向1：H型高血压管理与脑卒中预防战略性国际科技创新合作

研究方向2：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项

研究方向3: 代谢相关的人类疾病小型猪模型的构建及致病机理研究

（2）糖脂代谢

研究方向1：遗传性血液病蛋白质机器及标志物的发现与机制研究

研究方向2：HJV-Hepcidin-FPN核心轴调控铁稳态的新机制

研究方向3：热加工诱导食源铁储藏蛋白结构变化及对其铁吸收机制的影响

研究方向4：人ALKBH家族去甲基化酶的结构及调控机制研究

研究方向5：精子发生过程中生殖细胞-支持细胞的糖脂代谢偶联及功能研究

（3）肠道健康调控

研究方向1：益生菌生产关键技术科技成果转化

研究方向2：食品营养功能品质提升与安全检测技术研究

研究方向3：肠道黏膜免疫系统发育及其相关疾病的调控机制

研究方向4：针对神经退行性疾病的合成肠道菌群体系构建及应用

研究方向5：益生菌对食品中有害重金属的生物减除机制

（4）食品安全

研究方向1：畜禽重要病原菌抗生素耐药性形成、传播与控制的基础研究

研究方向2：农药化学污染物高通量侦测技术研究与示范

研究方向3：食品中化学危害因子非定向筛查技术研究

研究方向4：药物的代谢转归和耐药性形成机制

研究方向5：新型生物识别材料库的构建及其制备关键技术研究

（5）营养与健康食品制造  

研究方向1：中华传统食品工业化加工关键技术研究与装备开发

研究方向2：油炸烧烤食品杂环胺类危害物的生成途径与阻断方法

研究方向3：食用色素绿色制造技术研究

研究方向4：新型果蔬汁加工关键技术及装备研发

研究方向5：中华传统食品工业化加工关键技术研究与装备开发